Institutionsstyrelsen är det högsta beslutande organet på institutionen och ansvarar för de viktigaste övergripande besluten. Den bestämmer bland annat om budget, bokslut och hur verksamheten ska planeras. Styrelsen tar också beslut om hur undervisning och examination ska genomföras och godkänner och uppdaterar kursplaner. Utöver detta behandlar styrelsen frågor som prefekten senare fattar beslut om, liksom sådant som går vidare till fakultetsnämnden efter att institutionen lämnat sina förslag. Det kan röra sig om hur verksamheten ska organiseras, vilka åtgärder som behövs efter granskningar och utvärderingar samt när och hur rekrytering av nya lärare ska påbörjas. Uppdragets omfattning är uppskattningsvis 1-2 timmar för förberedelse per möte, samt möte om 1,5 timmar.